Το πάνελ CaRe προσφέρει ολοκληρωμένο γενετικό έλεγχο για κληρονομικές καρδιακές και νεφρικές διαταραχές, περιλαμβάνοντας ένα ευρύ φάσμα γονιδίων που παρακολοθούνται από την ClinGen με τεκμηριωμένες κλινικές εφαρμογές. Καλύπτει καρδιομυοπάθειες (υπερτροφική, διατατική, αρρυθμιογόνος), συγγενείς καρδιοπάθειες, αρρυθμίες (σύνδρομο μακρού QT, Brugada, κατεχολαμινεργική πολύμορφη κοιλιακή ταχυκαρδία), μυϊκές δυστροφίες με καρδιακή συμμετοχή, σύνδρομα RAS και αορτικά σύνδρομα. 

Οι κληρονομικές νεφροπάθειες καλύπτονται μέσω γονιδίων που ευθύνονται για πλήθος κλινικών εκδηλώσεων, όπως οικογενής αιματουρία, εστιακή τμηματική σπειραματοσκλήρυνση, νεφρωσικού τύπου πρωτεϊνουρία, κυστικοί νεφροί, σωληναριακή οξέωση, αιμολυτικό-ουραιμικό σύνδρομο, σωληναριοπάθειες, δυσλειτουργίες του συμπληρώματος και μεταβολικές διαταραχές. 

Το πάνελ είναι κατάλληλο για ασθενείς με χρόνιες καρδιομυοπάθειες ή νεφρικές παθήσεις άγνωστης γενετικής αιτιολογίας, προς υποστήριξη της διάγνωσης και καθοδήγηση θεραπείας και οικογενειακό γενετικό έλεγχο με υψηλή αξιοπιστία. 

Καρδιολογικά γονίδια 

ABCC9, ABCG5, ABCG8, ACTA1, ACTC1, ACTN1, ACTN2, ACVRL1, ADAMTS13, ALPK3, AMER1, ANK2, ANKRD1, ANKRD26, ANO5, AP3B1, ARPC1B, BAG3, BIN1, BLOC1S6, BRAF, CACNA1C, CACNB2, CALM1, CALM2, CALM3, CAPN3, CASQ2, CAV3, CBL, CDC42, CFL2, CHRNG, COL6A1, COL6A2, COL6A3, CRYAB, CSRP3, DAG1, DES, DMD, DNAJB6, DNM2, DSC2, DSG2, DSP, DTNBP1, DYSF, EMD, ENG, ETV6, EYA4, F10, F11, F12, F13A1, F13B, F2, F5, F7, F8, F9, FGA, FGB, FGG, FHOD3, FKRP, FKTN, FLNC, FLT4, FOXP3, FXN, GATA1, GATA4, GATA6, GBE1, GFI1B, GGCX, GLA, GP1BA, GP6, GP9, GRIP1, HCN4, HPS1, HPS3, HPS4, HPS5, HPS6, HRAS, ITGA2B, ITGB3, JPH2, JUP, KCNE1, KCNE2, KCNH2, KCNJ2, KCNQ1, KDM6A, KLKB1, KMT2D, KNG1, KRAS, LAMA2, LAMA4, LAMP2, LARGE1, LDB3, LMAN1, LMNA, LYST, LZTR1, MAP2K1, MAP2K2, MCFD2, MECOM, MEFV, MEGF10, MPL, MTM1, MYBPC3, MYH2, MYH6, MYH7, MYL2, MYL3, MYOM1, MYOZ2, MYPN, NBEAL2, NEB, NEBL, NEXN, NF1, NF2, NGLY1, NIPBL, NKX2-5, NRAS, OCA2, ORAI1, PDLIM3, PIEZO1, PKLR, PKP2, PLG, PLN, POMGNT1, POMGNT2, POMT1, POMT2, PPP1CB, PRDM16, PRKAG2, PROC, PROS1, PTPN11, RAF1, RASGRP2, RBM20, RBM8A, RIT1, RPS10, RPS24, RRAS2, RYR1, RYR2, SCN4A, SCN5A, SEPN1, SERPINC1, SERPIND1, SERPINE1, SERPINF2, SGCA, SGCB, SGCD, SGCG, SHOC2, SLC25A4, SMAD2, SMAD3, SMAD4, SOS1, SOS2, SPRED1, STAC3, STIM1, TCAP, TECRL, TGFB3, TGFBR1, TGFBR2, THPO, TMEM43, TMPO, TNNC1, TNNI3, TNNT1, TNNT2, TPM1, TPM2, TPM3, TRAPPC11, TRDN, TRIM32, TSC1, TSC2, TTN, TTR, TUBB1, TUBGCP6, VCL, VIPAS39, VPS33B, VWF 

Νεφρολογικά γονίδια 

ACTN4, ADCK4, AGXT, AHI1, ALG5, ALG8, ALG9, AMN, ANKS6, ANLN, APOA4, APOE, APOL1, APRT, AQP2, ARHGAP24, ARHGDIA, ARL13B, ARL6, ATP1A1, ATP6V0A4, ATP6V1B1, ATP6V1C2, ATXN10, AVIL, AVPR2, B9D1, B9D2, BBIP1, BBS1, BBS10, BBS12, BBS2, BBS4, BBS5, BBS7, BBS9, BSND, C21orf2, C3, C5orf42, C8orf37, CASR, CC2D2A, CCDC28B, CD151, CD2AP, CD46, CEP120, CEP164, CEP41, CFB, CFH, CFHR1, CFHR3, CFHR5, CFI, CLCN5, CLCNKB, CLDN10, CLDN16, CLDN19, CNNM2, COL4A1, COL4A2, COL4A3, COL4A4, COL4A5, COL4A6, COQ2, COQ6, CRB2, CSPP1, CTNS, CUBN, CUL3, CYP11B1, CYP11B2, CYP24A1, DCDC2, DDX59, DGKE, DNAJB11, DYNC2H1, DZIP1L, EGF, EHHADH, EVC, EVC2, EXOC8, FAM111A, FAN1, FN1, FOXI1, FRAS1, FXYD2, GANAB, GATM, GLIS2, GRHPR, HMOX1, HNF1B, HNF4A, HOGA1, HYLS1, ICK, IFT122, IFT140, IFT172, IFT43, IFT80, INF2, INPP5E, INVS, IQCB1, ITGA3, JAG1, KANK2, KAT6B, KCNA1, KCNJ1, KCNJ10, KCNJ16, KCNJ5, KIAA0586, KIF14, KIF7, KIRREL1, KLHL3, LAMA5, LAMB2, LMX1B, LRP5, LZTFL1, MAGI2, MITF, MKKS, MUC1, MYH9, MYO1E, NDUFAF6, NEDD4L, NEK1, NEK8, NOS1AP, NOTCH2, NPHP1, NPHP3, NPHP4, NPHS1, NPHS2, NR3C2, NUP107, NUP133, NUP93, NXF5, OCRL, P3H2, PAX2, PKD2, PKHD1, PLCE1, PRKCSH, PTPRO, REN, RPGRIP1L, RRAGD, SCLT1, SCNN1A, SCNN1B, SCNN1G, SDCCAG8, SEC61A1, SEC61B, SEC63, SLC12A1, SLC12A3, SLC12A7, SLC22A12, SLC26A1, SLC26A4, SLC2A9, SLC34A1, SLC34A3, SLC3A1, SLC41A1, SLC4A1, SLC5A1, SLC5A2, SLC7A9, SLC9A3R1, TAZ, TBC1D8B, TCTN1, TCTN2, TCTN3, THBD, TMEM138, TMEM216, TMEM231, TMEM237, TMEM67, TRIM8, TRPC6, TRPM6, TRPM7, TTC21B, TTC8, UMOD, UPK3A, WDPCP, WDR19, WDR34, WDR35, WDR72, WDR73, WNK1, WNK4, WT1, XPNPEP3, ZNF423 

PKD1 

Οι μεταλλάξεις στο γονίδιο PKD1 αποτελούν τη συχνότερη αιτία κληρονομικής νεφρικής νόσου. Πρόκειται για ένα από τα πιο τεχνικώς απαιτητικά γονίδια προς ανάλυση, λόγω της παρουσίας πολλών ομόλογων ψευδογονιδίων, τα οποία παρεμβαίνουν στις συνήθεις μεθόδους αλληλούχισης. Στο biobank.cy, έχουμε αναπτύξει και επικυρώσει ένα εξειδικευμένο πρωτόκολλο για τον έλεγχο του γονιδίου PKD1, εξασφαλίζοντας υψηλή ευαισθησία και ειδικότητα. 

Τα αποτελέσματα της αλληλούχισης συνδυάζονται με ανάλυση MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) του γονιδίου PKD1 για τον εντοπισμό μεγάλων ενθέσεων ή ελλείψεων. Αυτή η προσέγγιση μειώνει δραστικά τον κίνδυνο ψευδώς θετικών ή μη ανιχνεύσιμων παραλλαγών, προσφέροντας μεγαλύτερη αξιοπιστία στη διάγνωση της αυτοσωματικής επικρατούσας πολυκυστικής νόσου των νεφρών (ADPKD). 

MUC1 

Η Αυτοσωματική Επικρατούσα Σωληναριοενδιάμεση Νεφρική Νόσος λόγω μεταλλάξεων στο γονίδιο MUC1 (ADTKD-MUC1) είναι μια σπάνια συγγενής νεφροπάθεια με υψηλή επικράτηση στην Κύπρο. Οι μεταλλάξεις στην περιοχή VNTR (μεταβλητός αριθμός επαναλαμβανόμενων τμημάτων) του γονιδίου MUC1 καθιστούν τη γενετική διάγνωση σχεδόν αδύνατη. Το biobank.cy, σε συνεργασία με το Broad Institute του MIT και του Harvard (Μασαχουσέτη, ΗΠΑ), μπορεί να προσφέρει έλεγχο μεταλλάξεων μετατόπισης πλαισίου στο VNTR, μέσω καθιερωμένου διαγνωστικού τεστ με διαπίστευση CLIA (Clinical Laboratory Improvement Amendments). 

RFC1 

Το Σύνδρομο Παρεγκεφαλιδικής Αταξίας, Νευροπάθειας και Αιθουσαίας Αρρεφλεξίας (CANVAS) οφείλεται σε μετάλλαξη που περιλαμβάνει επέκταση επαναλαμβανόμενης αλληλουχίας AAGGG στο γονίδιο RFC1. Στα φυσιολογικά αντίγραφα του RFC1, οι επαναλήψεις παρουσιάζουν σταθερές νουκλεοτιδικές αλληλουχίες, όμως στο σύνδρομο CANVAS παρατηρείται διαταραχή στην αναλογία των βάσεων A και G. Για τον λόγο αυτό, έχουμε αναπτύξει και προσφέρουμε έλεγχο επαναλήψεων του RFC1 μέσω ειδικής ανά αλληλόμορφο ανάλυσης θραυσμάτων (allele-specific fragment analysis), με σκοπό την αξιόπιστη γενετική διάγνωση σε ύποπτα περιστατικά CANVAS. 

Το γονιδιακό πάνελ για την Οικογενή Υπερχοληστερολαιμία (FHL) περιλαμβάνει γονίδια που σχετίζονται με κληρονομικές διαταραχές του μεταβολισμού των λιπιδίων, όπως η οικογενής υπερχοληστερολαιμία (τύποι 1–3), η αβεταλιποπρωτεϊναιμία, η υποβεταλιποπρωτεϊναιμία, η υπερτριγλυκεριδαιμία, η υπερχυλομικροναιμία και οι ανεπάρκειες HDL (π.χ. νόσος Tangier). Το πάνελ καλύπτει επίσης σπάνιες μορφές συνδυασμένης υπερλιπιδαιμίας, υπερλιποπρωτεϊναιμίας και συνδρόμων που σχετίζονται με τα λιπίδια και έχουν συστημική συμμετοχή, όπως διαταραχές ρύθμισης βιταμινών και ορμονών, σπειραματοπάθειες και καρδιο-εγκεφαλικά συμβάματα. 

Το FHL είναι ιδανικό για ασθενείς με πρώιμη δυσλιπιδαιμία, ανεξήγητα καρδιαγγειακά επεισόδια, ή οικογενειακό ιστορικό μεταβολικών ή αγγειακών παθήσεων. 

PCSK9, APOB, MTTP, PROP1, PON1, EPHX2, LPL, NRG1, ABCA1, APOA5, LRP5, CETP, APOC2, APOE, CREB3L3, FUT2, LDLR

Η ολική αλληλούχιση του μιτοχονδριακού DNA (mtDNA) μπορεί να αποκαλύψει παθογόνες παραλλαγές που ευθύνονται για ένα ευρύ φάσμα μιτοχονδριακών νοσημάτων με προσβολή πολλαπλών οργανικών συστημάτων. Περιλαμβάνει συνδρόματα όπως νόσος Leigh, MELAS, MERRF, NARP, σύνδρομο Kearns-Sayre, καθώς και μιτοχονδριακές μυοπάθειες. Επιπλέον, η αλληλούχιση του mtDNA ανιχνεύει μεταλλάξεις που σχετίζονται με δυσανεξία στην άσκηση, γαλακτική οξέωση, καρδιομυοπάθειες, οπτικές νευροπάθειες όπως η κληρονομική οπτική νευροπάθεια Leber, αισθητηριονευρική απώλεια ακοής, νευροαναπτυξιακή καθυστέρηση, αταξίες, επιληψία, και συνδρομική νεφρική δυσλειτουργία. 

Δεδομένης της ετερογένειας και της επικάλυψης των κλινικών εκδηλώσεων των μιτοχονδριακών διαταραχών, το συγκεκριμένο πάνελ υποστηρίζει ολιστική διάγνωση και εξατομικευμένη κλινική προσέγγιση, τόσο σε παιδιατρικούς όσο και σε ενήλικες ασθενείς. 

Η Ολική Αλληλούχιση του Εξώματος (Whole Exome Sequencing – WES) αναλύει όλες τις περιοχές του γονιδιώματος που κωδικοποιούν για πρωτεΐνες, όπου και εντοπίζεται η πλειονότητα των γνωστών παθογόνων παραλλαγών. Η WES προσφέρει μια ολιστική προσέγγιση ανίχνευσης του κωδικοποιητικού γονιδιώματος, με σκοπό την αναγνώριση της γενετικής αιτίας σε άτομα με άτυπες ή σύνθετες φαινοτυπικές εκδηλώσεις. Τελικός στόχος είναι η υποστήριξη κλινικών αποφάσεων και η παροχή χρήσιμων πληροφοριών για μέλη της οικογένειας και για μελλοντικό οικογενειακό προγραμματισμό. Η εξέταση είναι διαθέσιμη ως Single WES (μόνο για τον ασθενή), Duo WES (ασθενής και ένας γονέας), Trio WES (ασθενής και οι δύο γονείς), ανάλογα με τις ανάγκες της κάθε περίπτωσης.